• ปัญหาสำคัญทางการเมืองของสาธารณรัฐบุรุนดี ได้แก่ ความขัดแย้งทางชาติพันธุ์ระหว่าง ชาว Tutsi ซึ่งแต่เดิมเป็นชนชั้นปกครอง (aristocracy) และชาว Hutu ซึ่งเคยเป็นชนชั้นใต้ปกครอง (vassal) และเป็นชนกลุ่มใหญ่ของประเทศ ซึ่งได้นำไปสู่ความรุนแรงในอดีตและยังคงเป็นปัจจัยสำคัญในการเมืองภายในของสาธารณรัฐบุรุนดี
• เมื่อวันที่ 13 พฤษภาคม 2558 ได้มีการพยายามก่อการรัฐประหาร ปธน. Nkurunziza โดยอดีต ผอ. ข่าวกรองสาธารณรัฐบุรุนดีเนื่องจากไม่พอใจต่อการประกาศลงรับเลือกตั้งเป็นสมัยที่ 3 ของ ปธน. แต่ไม่สำเร็จ อย่างไรก็ดี ภายหลัง ปธน. Nkurunziza ได้รับเลือกตั้งเป็นสมัยที่ 3 เมื่อวันที่ 21 กรกฎาคม 2558 สถานการณ์ความขัดแย้งทางการเมืองระหว่างฝ่ายรัฐบาลกับฝ่ายค้านและกลุ่มผู้ต่อต้านรัฐบาลยังคงมีความรุนแรงและเปราะบางอย่างต่อเนื่อง โดยล่าสุดมีผู้เสียชีวิตแล้วกว่า 400 คน ทั้งนี้มีการคาดการณ์ว่า จำนวนผู้เสียชีวิตอาจเพิ่มขึ้นถึง 1,000 คน และมีผู้อพยพออกนอกประเทศแล้วกว่า 432,140 คน (ข้อมูลจาก UNHCR ปี 2561)
• ไทยเคยส่งทหารช่าง 3 ผลัด จำนวนรวม 525 นาย เข้าร่วมภารกิจรักษาสันติภาพในสาธารณรัฐบุรุนดี (UNOB) ระหว่างปี 2547 - 2549
• ในช่วงปี 2551 - 2552 กระทรวงการต่างประเทศ และดร. กฤษณา ไกรสินธุ์ ได้ร่วมกันดำเนินโครงการถ่ายทอดเทคโนโลยีการผลิตยารักษาโรคมาลาเรียให้แก่ รัฐบาลบุรุนดี
• ในช่วงปี 2552 - 2554 กระทรวงการต่างประเทศและมูลนิธิขาเทียม ในสมเด็จพระศรีนครินทราบรมราชชนนีดำเนินโครงการจัดตั้งโรงงานขาเทียมให้แก่สาธารณรัฐบุรุนดี พร้อมมอบเครื่องมือ อุปกรณ์ และวัสดุการทำขาเทียมให้แก่สาธารณรัฐบุรุนดี